In einem Undercover-Einsatz wird Nick Torres (Wilmer Valderrama) bis an die Grenzen seiner Loyalität gedrängt. In der Zwischenzeit hofft McGee (Sean Murray) auf eine Beförderung, doch muss mit Zweifeln kämpfen, die ihn in eine falsche Bahn lenken könnten. Zudem kehrt Jessica Knight (Katrina Law) zurück, doch nichts ist mehr wie es einmal war. Zwischen dem kriminellen Chaos, alten Feinden und ihrer eigenen Zukunft muss sie herausfinden, wem sie wirklich vertrauen kann. Als dann auch noch nuklearer Stoff in Umlauf gerät, wird das Team mit einer Bedrohung konfrontiert, die weit über die normalen Fälle hinausgeht.