Noch immer führt Bruce Wayne (Stimme im Original: Hamish Linklater) seinen unerbittlichen Kampf als Batman gegen das Verbrechen in Gotham City fort. Während er versucht, die Stadt vor einer neuen Welle von Verbrechern zu schützen, tauchen immer gefährlicherer Gegner auf. So verfolgt der Riddler einen perfiden Plan und wie es scheint, arbeitet er nicht allein. Gleichzeitig sorgen auch Harley Quinn (Jamie Chung), Man-Bat oder der Mad Hatter für weiteres Chaos.