In den eisigen Gewässern setzt das atomgetriebene U-Boot seine riskante Mission fort. Kapitän Shiro Kaieda (Takao Osawa) muss nicht nur gegen einen überlegenen Gegner kämpfen, sondern sich auch mit den moralischen Konsequenzen seiner Entscheidungen auseinandersetzen. So beginnt ein tödlicher Kampf, bei dem ein einziger Fehler das Ende bedeuten kann. Auch die Lage an Land spitzt sich immer weiter zu, denn in Japan kommt es zu politischen Spannungen. Zusätzlich stellt sich der Premierminister offen hinter die umstrittene Mission.