Nachdem Operations Manager Henrietta Lange (Linda Hunt) ihren Rücktritt erklärt hat und vom Radar ihres Special Project Teams verschwunden ist, stehen einige Veränderungen an. Denn ihre Nachfolgerin Shay Mosley (Nia Long) bemüht einen personellen Wandel. Außerdem besteht Sam Hanna (LL Cool J) darauf, dass G. Callen (Chris O'Donnell) sich einen neuen Partner suchen soll. Callen geht daraufhin gemeinsam mit seiner Freundin Anastasia Kolcheck (Bar Paly) den Machenschaften einer Fälscherfamilie nach. Was das Team nicht weiß: Ihre zurückgetretene Ex-Vorgesetzte Hetty verfolgt in Vietnam ihre ganz eigene Agenda...