Der Geologe Scott Kinney (Brad Johnson) zeichnet die Aktivitäten eines Vulkans in der Region auf, als der Supergator, ein aus versteinerter DNS erschaffener prähistorischer Alligator aus einem geheimen Biotechnik-Forschungslabor ausbricht. Kinney tut sich mit einem anderen Wissenschaftler und einem texanischen Alligatorjäger zusammen, um das Monster zu verfolgen, während es sich flussabwärts bewegt, um ein luxuriöses Touristenresort zu zerstören.