Für die Schauspieler Robin Williams und Mickey Rooney ist "Nachts im Museum - Das geheimnisvolle Grabmahl" der letzte Film, den sie vor ihrem Tod abdrehten. Williams starb am 11. August 2014, Ronney bereits am 6. April 2014.
Vor Robin Williams' überraschendem Tod gab es bereits konkrete Pläne über Spin-offs mit den Figuren Roosevelt (Robin Williams) und Jedidiah (Owen Wilson).
In den beiden Vorgängerfilmen spielte jeweils Jake Cherry die Rolle von Nick Daley. Im dritten Teil übernahm Skyler Gisondo den Part.