In der nahen Zukunft wurde ein Großteil der Menschheit von einem hochansteckenden Virus dahingerafft. Doch auf einem Marine-Zerstörer hat eine Gruppe von Personen (u.a. Eric Dane und Rhona Mitra) die Katastrophe überstanden und forscht nun nach einem Heilmittel.
In einem angespannten Klima zwischen Polizeikräften und afroamerikanischer Bevölkerung versucht der schwarze Sergeant Daniel „Hondo“ Harrelson (Shemar Moore) als neuer Leiter eines S.W.A.T.-Teams die Situation zum Besseren zu wenden.